Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms