Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms