Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL1Q9NSC2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL1Q9NSC2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms