Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6BQ9NRW1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6BQ9NRW1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6BQ9NRW1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6BQ9NRW1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB6BQ9NRW1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms