Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX15Q9NRS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms