Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM10Q9NQV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM10Q9NQV6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms