Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms