Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms