Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK-5Q9HDB9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms