Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms