Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPJQ9HC77 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms