Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR55Q9H6Y2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR55Q9H6Y2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms