Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms