Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms