Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CIPCQ9C0C6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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