Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP74Q9C0B2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms