Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM31Q9BZY9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM31Q9BZY9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms