Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM3Q9BZL3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM3Q9BZL3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM3Q9BZL3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SMIM3Q9BZL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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