Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms