Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms