Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1orf50Q9BV19 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms