Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM43Q9BTV4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM43Q9BTV4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms