Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms