Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms