Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms