Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX2Q99697 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms