Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3Q99687 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3Q99687 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms