Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGPD5Q99666 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms