Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAT1Q99536 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms