Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms