Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms