Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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