Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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