Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms