Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms