Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms