Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAMP1Q96JM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms