Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG3Q96JB2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms