Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms