Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms