Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GCN1Q92616 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GCN1Q92616 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GCN1Q92616 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GCN1Q92616 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GCN1Q92616 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCN1Q92616 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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