Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBXN4Q92575 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms