Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPBP1Q92547 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms