Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RGP1Q92546 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms