Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMO7Q8WWI1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO7Q8WWI1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms