Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX29Q8TEQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms