Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC1Q8TE82 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3TC1Q8TE82 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms