Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms