Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD53Q8N9V6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms