Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS8Q8N3P4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms